测序底峰高是生物学家和研究人员重视的一个参数。 它是判断测序质量的一个重要指标，影响到最终测序准确度和可重复性。因此，保证测序底峰高，变得十分重要。
最简单的方式就是增加测序甲基化反应的加样量。但测序引物量又有限，往往很难增加。另一种可行的方案是增加size fractionation，将文库按照大小细分，将文库粒径很小而浓度极高的细小序列片段进行筛选出来，从而提高底峰高的同时，还可以优化保存质量，提高测序可重复性。虽然成本略高于加样量增加甲基化反应，但相对来讲，这种方法得到的结果更可靠，效率更高。
此外，检查测序文库的质量也是提高测序底峰高的重要手段。比如可以利用免疫检测或集成物芯片，快速快准地检查文库中的重要物质、分子结构和比例，消除测序混乱性，查错率不以前，尽可能的提高测序的准确性。
总之，当测序底峰高极高时，有利于实现快速准确的序列结果，从而有效促进基因组测序数据的科学分析和提供可靠的科学依据。提高至少30%以上，基本上可以确保测序质量。
